Ks. Tadeusz Isakowicz - Zaleski za swoją działalność na wielu obszarach został uhonorowany licznymi medalami i odznaczeniami.
Wśród najważniejszych wymienić należy
Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski (2006)
Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski (1999)
Medal Stulecia Odzyskanej Niepodległości (2019)
Medal „Pro Bono Poloniae” (2019)
Krzyż Wolności i Solidarności (2016)
Order Uśmiechu (1997)
Pozostałe nagrody i wyróżnienia
Człowiek Roku Gazety Krakowskiej (2020)
Tytuł Kustosza Pamięci Narodowej (2010)
Nagroda Rzecznika Praw Obywatelskich im. Pawła Włodkowica (2007)
Nagroda Literacka im. Józefa Mackiewicza (2007)
Nagroda Zasłużony dla NSZZ „Solidarność” (2008)
Nagroda Lodołamacz Specjalny (2008)
Skrzydła Super-Expressu (2007)
Nagroda św. Grzegorza Niezależnej Gazety Polskiej (2007)
Medal świętego Jerzego (1997, zwrócony 2008)
Honorowe członkostwo Światowego Kongresu Kresowian (2011)
Krzyż Czynu Zbrojnego Polskiej Samoobrony na Kresach Wschodnich RP (2011)
Krzyż Pamięci Ofiar Banderowskiego Ludobójstwa (2012)
Nagroda Toruński Anioł otrzymana od prezydenta Torunia (2011)
Honorowe obywatelstwo Zgierza (2012)
Honorowe obywatelstwo gminy Zielona Góra (2013)
Honorowe obywatelstwo gminy Zabierzów (2013)
Honorowe obywatelstwo gminy gminy Borów (2014)
Honorowe obywatelstwo Chełmka (2014)
Honorowe obywatelstwo Zielonej Góry (2016)
Honorowe obywatelstwo gminy Kadzidło (2017)
Honorowy ambasador miasta i gminy Prabuty (2014)
Medal „Za Zasługi dla Rozwoju Miasta i Ziemi Chrzanowskiej” (2014)
Srebrna odznaka „Za zasługi w pracy penitencjarnej” (2014)
Medal „Pro Memoria” (2017)
Medal Opoka im. Piotra Skórzyńskiego (2014)
Nagroda metropolity lwowskiego Eugeniusza Baziaka (2019)
Człowiek Roku Klubów Gazety Polskiej (2008)
